Phú Xuân là một trong những xã ở phía Nam của huyện Phú Tân, có tổng diện tích tự nhiên là 18,47 km2, chiếm khoảng 5,89 % diện tích tự nhiên của toàn huyện. Đơn vị hành chính xã Phú Xuân gồm có 4 ấp: Phú Đông, Phú Thu, Phú Hạ và Phú Tây.

Địa giới hành chính của xã Phú Xuân được xác định như sau:

+ Phía Bắc giáp xã Phú Thành.

+ Phía Tây giáp xã Hiệp Xương.

+ Phía Nam giáp xã Phú Hưng.